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| 方法名稱 | 常用試劑 | 原理 | 優點 | 缺點 | 適用場景 |
| BCA法 | BCA試劑盒 | 蛋白質在堿性環境下將Cu²?還原為Cu?，Cu?與BCA試劑反應生成紫色絡合物（562nm）。 | - 靈敏度高 | - 不同蛋白質因氨基酸組成不同，顯色有差異 | 常用、通用的方法之一，尤其適用于含有去垢劑的細胞裂解液樣品。 |
| - 抗干擾能力強（對去垢劑耐受性好） | - 反應時間較長 | ||||
| - 操作簡便 | |||||
| Bradford法 | 考馬斯亮藍G-250染料 | 染料與蛋白質的堿性氨基酸和芳香族氨基酸結合，顏色由棕紅色變為藍色（595nm）。 | - 非常快速（~5分鐘） | - 對去垢劑非常敏感（如SDS、Triton） | 適用于成分簡單、不含干擾去垢劑的純化蛋白樣品。 |
| - 靈敏度高 | - 不同蛋白質差異大 | ||||
| - 成本較低 | - 染料易附著在器皿上 | ||||
| Lowry法 | Folin-酚試劑 | 第一步與BCA類似（銅離子反應），第二步與Folin-酚試劑反應，增強信號。 | - 靈敏度高于BCA法 | - 步驟繁瑣 | 經典方法，現多被BCA法取代。 |
| - 干擾物質多 | |||||
| - 現已較少使用 | |||||
| 紫外吸收法 | 無特殊試劑，直接測量 | 利用蛋白質中Trp和Tyr在280nm的紫外吸收。 | - 無損樣品，可回收 | - 受核酸污染干擾嚴重（核酸在260nm有強吸收） | |
| - 極其快速簡便 | - 需要蛋白質含有芳香族氨基酸 | ||||
| - 無需制作標準曲線 |
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